RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321027.7

GCFC2-201, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCFC2, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-201ENST00000321027 SLC22A12Q96S37 553 aa14.71□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.71□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SCN1AP35498 2009 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 FEZF1A0PJY2 475 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 WRBO00258 174 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 MMP2P08253 660 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 AMZ1Q400G9 498 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF691Q5VV52 312 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 DNAJC13O75165 2243 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 A0A1W2PRQ8 180 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TSPAN4O14817 238 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 CDKN2CP42773 168 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 CEBPGP53567 150 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ID2Q02363 134 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ST3GAL3Q11203 375 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SUN5Q8TC36 379 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 DOK4Q8TEW6 326 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 GABRR3A8MPY1 467 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 FXYD1O00168 92 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 RHCEP18577 417 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 STX12Q86Y82 276 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 OR2L5Q8NG80 312 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 HMGB4Q8WW32 186 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM19Q96HH6 336 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 MCM3APO60318 1980 aa14.7□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 DLGAP1O14490 977 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SELENOWP63302 87 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 CAMK1Q14012 370 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 NFE2L1Q14494 772 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 CPZQ66K79 652 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SHFQ7M4L6 423 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 A8MU76 341 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ANHXE9PGG2 379 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SCGNO76038 276 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 MANEALQ5VSG8 457 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 UBE2FQ969M7 185 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 HAVCR1Q96D42 359 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 CEP290O15078 2479 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 LBX1P52954 281 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 UGT8Q16880 541 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ODF4Q2M2E3 257 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 NEIL2Q969S2 332 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 S100GP29377 79 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 NR4A2P43354 598 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SERPINA11Q86U17 422 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 WDR45Q9Y484 360 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 HSD17B2P37059 387 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 KEAP1Q14145 624 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-201ENST00000321027 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms