RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM64Q6YI46 380 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D19Q8N5T2 526 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 BBS10Q8TAM1 723 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 AMDHD1Q96NU7 426 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 OR51I1Q9H343 314 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 GLIPR2Q9H4G4 154 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 PEX16Q9Y5Y5 336 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PRQ8 180 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 M0R129 80 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 UGT2B17O75795 530 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 UPK1BO75841 260 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 HSMCR30P0CW71 290 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 OR12D1P0DN82 309 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 NR2F1P10589 423 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 GJA4P35212 333 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SOX6P35712 828 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 XKP51811 444 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 CRISP3P54108 245 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 PRKCDQ05655 676 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SLC9A5Q14940 896 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MED22Q15528 200 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 IL17RCQ8NAC3 791 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 OR8J1Q8NGP2 316 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 OR2A1Q8NGT9 310 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SFXN5Q8TD22 340 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 NRTNQ99748 197 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 FUZQ9BT04 418 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 OR51E2Q9H255 320 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 BCL2L10Q9HD36 194 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MYO7AQ13402 2215 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SERPIND1P05546 499 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ACP5P13686 325 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 PKLRP30613 574 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ABATP80404 500 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 NCF4Q15080 339 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SEC23BQ15437 767 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 CD300LDQ6UXZ3 194 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MOAP1Q96BY2 351 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 BBS4Q96RK4 519 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 CDADC1Q9BWV3 514 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SERHL2Q9H4I8 314 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MVB12BQ9H7P6 319 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SP140LQ9H930 580 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 HCN2Q9UL51 889 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MKLN1Q9UL63 735 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SLC6A14Q9UN76 642 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 CFL2Q9Y281 166 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 OR1A2Q9Y585 309 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 STON1Q9Y6Q2 735 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 DSCR3O14972 297 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 GRK5P34947 590 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 IRF4Q15306 451 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ZIC1Q15915 447 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 RNLSQ5VYX0 342 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 PGBD2Q6P3X8 592 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM69Q86WT6 500 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 NLGN4XQ8N0W4 816 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf16Q9NQ32 467 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 TRPC4Q9UBN4 977 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 H3BN98 237 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MAN2B1O00754 1011 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SEMA7AO75326 666 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ENTPD6O75354 484 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 FCARP24071 287 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.555e-7■□□□□ 10.3
SPNS1-201ENST00000311008 KRT33BQ14525 404 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 SYPL1Q16563 259 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM80Q96HE8 168 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 FAM227AF5H4B4 570 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-201ENST00000311008 KDM1AO60341 852 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms