RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NPAP1Q9NZP6 1156 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 SEC14L3Q9UDX4 400 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TAC3Q9UHF0 121 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 STUB1Q9UNE7 303 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RTCAO00442 366 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RPN2P04844 631 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CYP17A1P05093 508 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TNFSF8P32971 234 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 FEN1P39748 380 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 DGKEP52429 567 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ZNF91Q05481 1191 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NUDT13Q86X67 352 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NANOGP1Q8N7R0 232 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TMCO6Q96DC7 493 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ABCG4Q9H172 646 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NT5DC2Q9H857 520 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NDUFB11Q9NX14 153 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NOTCH4Q99466 2003 aa26.54■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ANHXE9PGG2 379 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ADRB3P13945 408 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CCR8P51685 355 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 UBE3AQ05086 875 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 MLC1Q15049 377 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 P2RX2Q9UBL9 471 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 B4GALT2O60909 372 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 MAGP20916 626 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 SOX3P41225 446 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RORCP51449 518 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 REEP5Q00765 189 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 C1DQ13901 141 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TMEM52BQ4KMG9 183 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 LINC00471Q8N535 108 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 FBXL12Q9NXK8 326 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CLEC2DQ9UHP7 191 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ADAM29Q9UKF5 820 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.53■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 LINC01553A4QN01 128 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 UGT2B17O75795 530 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CKMT1AP12532 417 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 RPS19P39019 145 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CRYBB2P43320 205 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CCT3P49368 545 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 LBX1P52954 281 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 COX10Q12887 443 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 NDUFA9Q16795 377 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A30Q5SVS4 291 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 CD300LDQ6UXZ3 194 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 AMZ2Q86W34 360 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 IL17RDQ8NFM7 739 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 TSSK6Q9BXA6 273 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 HOXD1Q9GZZ0 328 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.52■■□□□ 1.84
UBP1-201ENST00000283628 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PRQ8 180 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC28A2O43868 658 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CARTPTQ16568 116 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 C9orf64Q5T6V5 341 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR4D11Q8NGI4 311 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OR5K2Q8NHB8 316 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A13Q8TCU3 470 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 RGMAQ96B86 450 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A18Q96N87 628 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN32Q9NX65 697 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 POU2F3Q9UKI9 436 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 HYKKA2RU49 373 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 GSTT2P0CG29 244 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 GSTT2BP0CG30 244 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 OPRD1P41143 372 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 C12orf40Q86WS4 652 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 FAM26EQ8N5C1 309 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 TCEANCQ8N8B7 351 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 WDFY2Q96P53 400 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 LHX9Q9NQ69 397 aa26.51■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 ADH1CP00326 375 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 EPCAMP16422 314 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 NTHL1P78549 312 aa26.5■■□□□ 1.83
UBP1-201ENST00000283628 CAMK1Q14012 370 aa26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms