RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 MAP2K4P45985 399 aa15.5■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 C6orf120Q7Z4R8 191 aa15.5■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.49■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CTCF-201ENST00000264010 A8MUA0 341 aa15.49■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa15.49■□□□□ 0.07
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CTCF-201ENST00000264010 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCF-201ENST00000264010 EQTNQ9NQ60 294 aa15.48■□□□□ 0.07
CTCF-201ENST00000264010 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTCF-201ENST00000264010 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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