RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641815.1

STX3-208, Transcript of syntaxin 3, human

BASIC

Gene STX3, Length 3,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX3-208	ENST00000641815	UGT2B10	P36537	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	NDST1	P52848	882 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ARSF	P54793	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	POU4F1	Q01851	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	AQP6	Q13520	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ZNF273	Q14593	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CA9	Q16790	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	EID2B	Q96D98	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	OMA1	Q96E52	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SMO	Q99835	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ASCL2	Q99929	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MMP27	Q9H306	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	HS3ST1	O14792	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	TBX19	O60806	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SNAPIN	O95295	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ALPL	P05186	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	STS	P08842	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	BMP4	P12644	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	PEPD	P12955	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	PCMT1	P22061	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	POU1F1	P28069	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	PSMB4	P28070	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	RCVRN	P35243	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CXCR4	P61073	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	IFITM3	Q01628	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ZNF45	Q02386	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CD300C	Q08708	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	VEZF1	Q14119	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	IER5	Q5VY09	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MARK4	Q96L34	752 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61	2e-10	■■■■■ 31.3
STX3-208	ENST00000641815	ASB7	Q9H672	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STX3-208	ENST00000641815	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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