RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	CYS1	Q717R9	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXL20	Q96IG2	436 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CNIH4	Q9P003	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOT9	Q9Y305	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CENPE	Q02224	2701 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1B0GVC2	190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TP53I11	O14683	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	KLK8	O60259	260 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	GLI4	P10075	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NR2F6	P10588	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	IGFBP2	P18065	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT15	P19012	456 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	GDF1	P27539	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	MASP1	P48740	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PLTP	P55058	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TFF3	Q07654	80 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NAB1	Q13506	487 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM198	Q66K66	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	RIT1	Q92963	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	DVL2	O14641	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TP73	O15350	636 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	RAD51C	O43502	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CELA3A	P09093	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	EPOR	P19235	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	UQCRC1	P31930	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NRG3	P56975	720 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TOMM20	Q15388	145 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	4e-7	■□□□□ 10.8
TARDBP-231	ENST00000639599	HSPB2	Q16082	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NUDT13	Q86X67	352 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	DIO2	Q92813	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599		Q9UFV3	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	PLPP1	O14494	284 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM155B	O75949	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR75	O95800	540 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	GCK	P35557	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	MAGEA4	P43358	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	KIR2DL3	P43628	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	TRPC1	P48995	793 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TARDBP-231	ENST00000639599	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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