RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM9BQ9NQ34 198 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTBP11277 2137 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK5O95279 499 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NCK1P16333 377 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX11P35716 441 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 XKP51811 444 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 VAC14Q08AM6 782 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CPZQ66K79 652 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL10Q6ZVT0 673 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA24Q86W54 205 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NAXDQ8IW45 347 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 LRGUKQ96M69 825 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A14Q9HCY8 104 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP12BA6NM10 295 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT75O95678 551 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 C8BP07358 591 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GPC1P35052 558 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ARSFP54793 590 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RHDQ02161 417 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CSRP2Q16527 193 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SAXO2Q658L1 398 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GLYATQ6IB77 296 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4N5Q8IXE1 308 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP12AQ8IXF9 295 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PYDC1Q8WXC3 89 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NEURL3Q96EH8 262 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NDC1Q9BTX1 674 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA9Q9BWV2 254 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM15Q9C019 465 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 H0Y3Z8 333 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CBFA2T3O75081 653 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT3P49368 545 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 FOLH1Q04609 750 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 FADDQ13158 208 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RCN1Q15293 331 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRM1Q16186 407 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP51A1Q16850 503 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF19Q5T6S3 580 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM64Q6YI46 380 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SPPL2CQ8IUH8 684 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX11GQ96HA9 241 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD21L1Q9H4I0 556 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA3GQ9NS98 782 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 BLACEA4D250 179 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF17O60258 216 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GALT2O60909 372 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 LRP3O75074 770 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 LDB3O75112 727 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR75O95800 540 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CPMP14384 443 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SNCBQ16143 134 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT16Q17RD7 645 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 COX20Q5RI15 118 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF130Q86XS8 419 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PTOV1Q86YD1 416 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZZZ3Q8IYH5 903 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C1Q96RD1 312 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GORASP2Q9H8Y8 452 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DSCR3O14972 297 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTA4O15217 222 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ALAS2P22557 587 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AP2B1P63010 937 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE7PQ495Y7 208 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ERICH5Q6P6B1 374 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf120Q7Z4R8 191 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR9A2Q8NGT5 310 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SFXN5Q8TD22 340 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PARD6AQ9NPB6 346 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 NDOR1Q9UHB4 597 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
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