RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.865e-6■□□□□ 8.4
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SGMS1-210ENST00000619438 DAG1Q14118 895 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 MYBPC3Q14896 1274 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 TGIF1Q15583 401 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.39■□□□□ 0.86
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SGMS1-210ENST00000619438 C10orf111Q8N326 155 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 SVOPLQ8N434 492 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO30Q8TB52 745 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2E3Q969T4 207 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 TMBIM1Q969X1 311 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 CRELD1Q96HD1 420 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 OR6C1Q96RD1 312 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 PANX1Q96RD7 426 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 ZPBPQ9BS86 351 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 APMAPQ9HDC9 416 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.39■□□□□ 0.86
SGMS1-210ENST00000619438 CLIC1O00299 241 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PRKD3O94806 890 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 CCNDBP1O95273 360 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ERGP11308 486 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PCNAP12004 261 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 SHMT2P34897 504 aa20.38■□□□□ 0.85
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SGMS1-210ENST00000619438 PIK3CBP42338 1070 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 CLN3Q13286 438 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 NADK2Q4G0N4 442 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 CPZQ66K79 652 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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SGMS1-210ENST00000619438 DUSP26Q9BV47 211 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PIPSLA2A3N6 862 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf74A8MZ97 194 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 BTN3A3O00478 584 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 B3GALT4O96024 378 aa20.38■□□□□ 0.85
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SGMS1-210ENST00000619438 LCTLQ6UWM7 567 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D20Q96BZ9 403 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PYURFQ96I23 114 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 USE1Q9NZ43 259 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.38■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 MGAQ8IWI9 3026 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 GABRR3A8MPY1 467 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SGMS1-210ENST00000619438 LAMP1P11279 417 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 HSD17B2P37059 387 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA2P43356 314 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 UCNP55089 124 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 IL11RAQ14626 422 aa20.37■□□□□ 0.85
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SGMS1-210ENST00000619438 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 KMT5CQ86Y97 462 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 NCLNQ969V3 563 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ICKQ9UPZ9 632 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.37■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa20.36■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 PCDH7O60245 1069 aa20.36■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINA1P01009 418 aa20.36■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 CST1P01037 141 aa20.36■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SGMS1-210ENST00000619438 ATP6V1B1P15313 513 aa20.36■□□□□ 0.85
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