RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR10A6	Q8NH74	314 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM63	Q969Q1	353 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MUL1	Q969V5	352 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RGMA	Q96B86	450 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PANX1	Q96RD7	426 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CSF3R	Q99062	836 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ING2	Q9H160	280 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	AURKC	Q9UQB9	309 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EI24	O14681	340 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TMPRSS11D	O60235	418 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MAG	P20916	626 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SOX11	P35716	441 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HHEX	Q03014	270 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR10G6	Q8NH81	332 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM110B	Q8TC76	370 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MTERF3	Q96E29	417 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BDH2	Q9BUT1	245 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MARCH7	Q9H992	704 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A0A6YYD5	115 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318		B4DGG1	531 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SNPH	O15079	494 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ALX3	O95076	343 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PTTG1	O95997	202 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HPR	P00739	348 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LDLR	P01130	860 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SERPIND1	P05546	499 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LSS	P48449	732 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPK12	P53778	367 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TTC23	Q5W5X9	447 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FCRL6	Q6DN72	434 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TSSK4	Q6SA08	328 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	USP43	Q70EL4	1123 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NUDT13	Q86X67	352 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SPART	Q8N0X7	666 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NEK6	Q9HC98	313 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		14.6	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A0G2JN53	185 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf226	A1L170	272 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GSAP	A4D1B5	854 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318		M0R3G1	203 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CTSV	O60911	334 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GABARAP	O95166	117 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CRHBP	P24387	322 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HOXA6	P31267	233 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ELOC	Q15369	112 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SPESP1	Q6UW49	350 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2T12	Q8NG77	320 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LMX1A	Q8TE12	382 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BAG5	Q9UL15	447 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TAF4	O00268	1085 aa		14.58	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZW10	O43264	779 aa		14.58	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MAN1A2	O60476	641 aa		14.58	□□□□□ -0.07

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