RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 LINGO1Q96FE5 620 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SORT1Q99523 831 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 Q9UFV3 132 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 OARD1Q9Y530 152 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HIVEP2P31629 2446 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 OR14I1A6ND48 311 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 GFYI3L273 518 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 EBAG9O00559 213 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DVL2O14641 736 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 WDR1O75083 606 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MATN4O95460 622 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 GLI4P10075 376 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ARRB2P32121 409 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NAGLUP54802 743 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SLC26A5P58743 744 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TGFBIQ15582 683 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ZSCAN26Q16670 478 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 GPSM1Q86YR5 675 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf82Q8WW14 230 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ASB11Q8WXH4 323 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 Q96MF0 132 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 FAM107BQ9H098 131 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 EXO5Q9H790 373 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RNF112Q9ULX5 631 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.65□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.65□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 STAB1Q9NY15 2570 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 OR2W5A6NFC9 320 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 FAM166BA8MTA8 275 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 CDC7O00311 574 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 SMPD2O60906 423 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf105O95561 183 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA2P01563 188 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 BMP7P18075 431 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 IL1RNP18510 177 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 GGT5P36269 586 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 ASCL1P50553 236 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 AP1S2P56377 157 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 MLF1P58340 268 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 SETDB1Q15047 1291 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 WLSQ5T9L3 541 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 ELP5Q8TE02 316 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 SMPDL3AQ92484 453 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM237Q96Q45 408 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 OR2A5Q96R48 311 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-215ENST00000560424 LDAHQ9H6V9 325 aa8.64□□□□□ -1.03
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