RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	AHSP	Q9NZD4	102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SVIL	O95425	2214 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	OR6B1	O95007	311 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ESRRB	O95718	433 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CPA3	P15088	417 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PTGER1	P34995	402 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SOX3	P41225	446 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	NAGLU	P54802	743 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PKNOX1	P55347	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PCLAF	Q15004	111 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MYOT	Q9UBF9	498 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ULK1	O75385	1050 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SPAG7	O75391	227 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	UNC5C	O95185	931 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HSD3B1	P14060	373 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HSD3B2	P26439	372 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PIK3R1	P27986	724 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RFC3	P40938	356 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	DNAJB13	P59910	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GPR85	P60893	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ASB15	Q8WXK1	588 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RIT1	Q92963	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	APIP	Q96GX9	242 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	EBPL	Q9BY08	206 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	OXSM	Q9NWU1	459 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642		A0A0G2JMM0	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642		A0A1W2PPB8	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642		A0A1W2PRS3	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642		A8MVJ9	347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642		G3V3Y1	287 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	DYRK3	O43781	588 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	PCDH7	O60245	1069 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	CLPS	P04118	112 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	CT62	P0C5K7	136 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	SSTR4	P31391	388 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	ALDH9A1	P49189	494 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BMP4-208	ENST00000559642	MEOX1	P50221	254 aa		11.95	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms