RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	VLDLR	P98155	873 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PROX1	Q92786	737 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	COG8	Q96MW5	612 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	LAMA5	O15230	3695 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-223	ENST00000550442	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PCM1	Q15154	2024 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A0A6YYD5	115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1W2PPV9	198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	YY2	O15391	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	OR1F1	O43749	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	NTRK1	P04629	796 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CEACAM5	P06731	702 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF12	P17014	697 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	MPI	P34949	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SOX11	P35716	441 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GGT2	P36268	569 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNGR2	P38484	337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GALK1	P51570	392 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CDH15	P55291	814 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CDC42	P60953	191 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PRR5	P85299	388 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	GAB1	Q13480	694 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	IRF4	Q15306	451 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	NUDT8	Q8WV74	236 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	LAMA1	P25391	3075 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ACACA	Q13085	2346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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