RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516136.1

RNA5SP411-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 411, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP411, Length 114 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP411-201ENST00000516136 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.51□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.51□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 A0A0G2JMM0 328 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 A0A1B0GVC2 190 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 A0A1W2PPB8 328 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 A0A1W2PRS3 328 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ESYT3A0FGR9 886 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 AQP7O14520 342 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SUSD5O60279 629 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 OR10H2O60403 315 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CLDN9O95484 217 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 IGHG3P01860 377 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CCL3P10147 92 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 MAGEA5P43359 124 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 PMPCAQ10713 525 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SLC10A1Q14973 349 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 EMC4Q5J8M3 183 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 C18orf63Q68DL7 685 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TRILQ7L0X0 811 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 L3MBTL4Q8NA19 623 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ACBD4Q8NC06 268 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 RIT1Q92963 219 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SMC6Q96SB8 1091 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 VPS11Q9H270 941 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 LDAHQ9H6V9 325 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CNIH4Q9P003 139 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TMCO1Q9UM00 188 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 RNF6Q9Y252 685 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ASB4Q9Y574 426 aa9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 A0A0A6YYD5 115 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 A0A1W2PR48 441 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 HMX2A2RU54 273 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 OR6C76A6NM76 312 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CAPN14A8MX76 684 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 HRKO00198 91 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 HCN1O60741 890 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 RBP1P09455 135 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 NR2F6P10588 404 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ACVR2AP27037 513 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 GALNSP34059 522 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 BSGP35613 385 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 DNASE1L1P49184 302 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 MAN2A2P49641 1150 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 CCNG1P51959 295 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 NUP107P57740 925 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 HERVK_113P63132 956 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ERVK-8P63133 956 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TLE4Q04727 773 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 FOXO1Q12778 655 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 NUDT13Q86X67 352 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SARAFQ96BY9 339 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 GPR78Q96P69 363 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 SERPINI1Q99574 410 aa9.49□□□□□ -0.89
RNA5SP411-201ENST00000516136 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms