RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 ERASQ7Z444 233 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CUZD1Q86UP6 607 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CNBD1Q8NA66 436 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 LIPHQ8WWY8 451 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 MCHR2Q969V1 340 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC51Q96ER9 411 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 ACCSQ96QU6 501 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 TPPP3Q9BW30 176 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-205ENST00000514178 SCN5AQ14524 2016 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SH2D1BO14796 132 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHEP01854 428 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CCKARP32238 428 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RY14Q15391 338 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 LCA5Q86VQ0 697 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RDH11Q8TC12 318 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGED4Q96JG8 741 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ERP44Q9BS26 406 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NLNQ9BYT8 704 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PALMDQ9NP74 551 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF175Q9Y473 711 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GUL7 405 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEC1O60732 1142 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CEACAM4O75871 244 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV2-11P01706 119 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PCCBP05166 539 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT8P05787 483 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CA3P07451 260 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PATE4P0C8F1 98 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 GP9P14770 177 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 EDNRAP25101 427 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CHRNB4P30926 498 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ADRA1AP35348 466 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CDKL1Q00532 357 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 RIGQ13278 110 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NEPROQ6NW34 567 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZSR9 355 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ASRGL1Q7L266 308 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MLKLQ8NB16 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO30Q8TB52 745 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TCP11Q8WWU5 503 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRUQ92729 1446 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PINK1Q9BXM7 581 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 KLK11Q9UBX7 282 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5H15A6NDH6 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CEBPBP17676 345 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 HNMTP50135 292 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 NODALQ96S42 347 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 MEI4A8MW99 385 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM72CH0Y354 149 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 HPRP00739 348 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 FCER2P06734 321 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 THRBP10828 461 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-205ENST00000514178 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms