RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513524.5

GPBP1-206, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 5

Gene GPBP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-206	ENST00000513524	NME3	Q13232	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		K7EQD1	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZFAND5	O76080	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CHRNA3	P32297	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	P2RY14	Q15391	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		Q6ZRG5	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		A0A0J9YWU9	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524		H7C423	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RALA	P11233	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PRDX6	P30041	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CCND2	P30279	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FCGR2C	P31995	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	GPC3	P51654	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CRYBA2	P53672	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPBP1-206	ENST00000513524	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPBP1-206	ENST00000513524	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPBP1-206	ENST00000513524	DCX	O43602	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPBP1-206	ENST00000513524	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPBP1-206	ENST00000513524	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPBP1-206	ENST00000513524	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPBP1-206	ENST00000513524	DNAJB1	P25685	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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