RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LAMA5O15230 3695 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR5K3A6NET4 321 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 APOA1P02647 267 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSPAN8P19075 237 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD1CP29017 333 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 HNMTP50135 292 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GFERP55789 205 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH3BP2P78314 561 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF45Q02386 682 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MVKQ03426 396 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KANK2Q63ZY3 851 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 STEAP3Q658P3 488 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF544Q6NX49 715 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 USP53Q70EK8 1073 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AVL9Q8NBF6 648 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SETD9Q8NE22 299 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR56A3Q8NH54 315 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TP53INP1Q96A56 240 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LGALS12Q96DT0 336 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCN3BQ9NY72 215 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.26□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 A6NL46 340 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 C9JVG2 144 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GNGT2O14610 69 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBX1O43435 398 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PROS1P07225 676 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 NAT1P18440 290 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 EPORP19235 508 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACP1P24666 158 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SOX11P35716 441 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GGT5P36269 586 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR3P46089 330 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIMK1P53667 647 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GNG2P59768 71 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP2R2BQ00005 443 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 FADDQ13158 208 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF404Q494X3 552 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGAP6Q5VW22 663 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 DESI1Q6ICB0 168 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 NAT6Q93015 286 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM74Q96NL1 305 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGAP4Q96P64 663 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 BTBD2Q9BX70 525 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SGPP1Q9BX95 441 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD244Q9BZW8 370 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TAC3Q9UHF0 121 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A1B0GTL3 188 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 GSAPA4D1B5 854 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 AGAP5A6NIR3 686 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLDN24A6NM45 220 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 E2F3O00716 465 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP6CO00743 305 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TM4SF5O14894 197 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC16A6O15403 523 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC22A3O75751 556 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 WDR47O94967 919 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANGPTL1O95841 491 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIGAP37287 484 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CASP2P42575 452 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LSSP48449 732 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEPHS1P49903 392 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR4D2P58180 307 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCL7P80098 99 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRAF3Q13114 568 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDK5R2Q13319 367 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC157Q569K6 752 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SIMC1Q8NDZ2 872 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBTD2Q8WUN7 234 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH3GL1Q99961 368 aa11.25□□□□□ -0.61
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms