RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 GOLM1Q8NBJ4 401 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 C7orf57Q8NEG2 295 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 OR5L2Q8NGL0 311 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 REPS1Q96D71 796 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 FBXL20Q96IG2 436 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 FMO2Q99518 471 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 NTMT1Q9BV86 223 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 TTTY12Q9BZ98 90 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 XPR1Q9UBH6 696 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 AKAP9Q99996 3911 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GTL3 188 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 G3V3Y1 287 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 STX16O14662 325 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN9O95484 217 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN14O95500 239 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 INHBAP08476 426 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 TNFRSF8P28908 595 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 FOXO1Q12778 655 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 ASPHQ12797 758 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 BIKQ13323 160 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 CD163Q86VB7 1156 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 DOK4Q8TEW6 326 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 PHF21BQ96EK2 531 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 CENPKQ9BS16 269 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 COPS7AQ9UBW8 275 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PS29 197 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GPR75O95800 540 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 AIFM1O95831 613 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 RBP1P09455 135 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 FAM58BPP0C7Q3 252 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 CCL3P10147 92 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 COX7A2P14406 83 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 CNR1P21554 472 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINB9P50453 376 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PLIN5Q00G26 463 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 OPN5Q6U736 354 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ACBD4Q8NC06 268 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 IFT81Q8WYA0 676 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 SGCZQ96LD1 299 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB127Q9H1M4 99 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF180Q9UJW8 692 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GLOD5A6NK44 160 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 FAM166BA8MTA8 275 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PDE9AO76083 593 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 SEMA3DO95025 777 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 NR2F6P10588 404 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PTGER4P35408 488 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 KIR3DL1P43629 444 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PPIAP62937 165 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PHEXP78562 749 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 FAM219BQ5XKK7 198 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM8Q9BZR9 551 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 LIPGQ9Y5X9 500 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GBAP04062 536 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TPOP07202 933 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 RPS17P08708 135 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 COL6A2P12110 1019 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GCAP28676 217 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 HERVK_113P63132 956 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ERVK-8P63133 956 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 HYAL4Q2M3T9 481 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 NUDT13Q86X67 352 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 RPRMLQ8N4K4 120 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 FAM173AQ9BQD7 235 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ERVK-6Q9BXR3 956 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TMCO1Q9UM00 188 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 ERVK-19Q9WJR5 959 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PPP6CO00743 305 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 PGRMC2O15173 223 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 IGHG3P01860 377 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GALNSP34059 522 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 DNASE1L1P49184 302 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 SLC37A1P57057 533 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GGTA1PQ4G0N0 100 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 FRG2Q64ET8 278 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB3-211ENST00000490677 RGS9BPQ6ZS82 235 aa25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms