RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489617.5

CDK18-211, Transcript of cyclin dependent kinase 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CDK18, Length 3,190 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18-211ENST00000489617 ING4Q9UNL4 249 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 FAM234BA2RU67 622 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 OR6C74A6NCV1 312 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ARPC2O15144 300 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KDM4BO94953 1096 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ANGPTL1O95841 491 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ETV6P41212 452 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 IL5RAQ01344 420 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 FADDQ13158 208 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 LCN8Q6JVE9 175 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ASPGQ86U10 573 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PGBD3Q8N328 593 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MIER2Q8N344 545 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SH3RF2Q8TEC5 729 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 QRFPRQ96P65 431 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GSTO2Q9H4Y5 243 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ALG9Q9H6U8 611 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.06□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GPR171O14626 319 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SELENOFO60613 162 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MOSPD3O75425 235 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 F11P03951 625 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GP1BAP07359 652 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 HSD17B1P14061 328 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 TIE1P35590 1138 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ISL1P61371 349 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PROX2Q3B8N5 592 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 EXT2Q93063 718 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 LRRC46Q96FV0 321 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GHRLQ9UBU3 117 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SCML2Q9UQR0 700 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 IRAK3Q9Y616 596 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ZNF197O14709 1029 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PDCD5O14737 125 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MBP02144 154 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GPIP06744 558 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CHRM3P20309 590 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PDHA2P29803 388 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CHRNA4P43681 627 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ACTR1AP61163 376 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KCNAB2Q13303 367 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ZNF789Q5FWF6 425 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 FGF14Q92915 247 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 RNF145Q96MT1 663 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 NEU1Q99519 415 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SLC30A3Q99726 388 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 RNF6Q9Y252 685 aa11.05□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 TCAPO15273 167 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 RAC2P15153 192 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SLC6A2P23975 617 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GRK5P34947 590 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CD86P42081 329 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 CDK5R2Q13319 367 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PARM1Q6UWI2 310 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 GPR151Q8TDV0 419 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SLC38A4Q969I6 547 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 LRRC58Q96CX6 371 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 FCRL5Q96RD9 977 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 MYADMQ96S97 322 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.04□□□□□ -0.64
CDK18-211ENST00000489617 DHRS7Q9Y394 339 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms