RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489157.5

TAPBP-241, Transcript of TAP binding protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TAPBP, Length 1,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBP-241ENST00000489157 NAB1Q13506 487 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GXYLT1Q4G148 440 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GPR180Q86V85 440 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 EID3Q8N140 333 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ACBD4Q8NC06 268 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 OR8K3Q8NH51 312 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 IFT81Q8WYA0 676 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GPR78Q96P69 363 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 FAM173AQ9BQD7 235 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ACTR8Q9H981 624 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SACM1LQ9NTJ5 587 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF358Q9NW07 568 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.05□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 A0A087X1B8 175 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 A0A096LPK6 155 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SYCE1LA8MT33 242 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GBAP04062 536 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 P04436 131 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 COX7A2P14406 83 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SERPINB1P30740 379 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SSTR2P30874 369 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 BSGP35613 385 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PIK3CBP42338 1070 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 HERVK_113P63132 956 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ERVK-8P63133 956 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 TLE4Q04727 773 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GTF2H2Q13888 395 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PIGGQ5H8A4 983 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PRAMEF20Q5VT98 475 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF585AQ6P3V2 769 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 OPN5Q6U736 354 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 LYPD8Q6UX82 237 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GK5Q6ZS86 529 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GOLM1Q8NBJ4 401 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 OR5M3Q8NGP4 307 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CDK15Q96Q40 435 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SMC6Q96SB8 1091 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ERVK-6Q9BXR3 956 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 IPPKQ9H8X2 491 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 NINJ2Q9NZG7 142 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ASB4Q9Y574 426 aa13.04□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 A0A0A6YYD5 115 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 A0A1W2PR48 441 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PROM1O43490 865 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 KLK8O60259 260 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 KLHL2O95198 593 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 IGHG3P01860 377 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CLPSP04118 112 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 RFPL3SP0C7P2 107 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CHRNB4P30926 498 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PLIN5Q00G26 463 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 TFF3Q07654 80 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ACAP2Q15057 778 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 MPEG1Q2M385 716 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 LIPJQ5W064 366 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 RTL6Q6ICC9 239 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 PAOXQ6QHF9 649 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 TRILQ7L0X0 811 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 FAM109AQ8N4B1 249 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 NUBPLQ8TB37 319 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 WDR20Q8TBZ3 569 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 RND1Q92730 232 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 TANKQ92844 425 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 FBXL20Q96IG2 436 aa13.03□□□□□ -0.32
TAPBP-241ENST00000489157 SGCZQ96LD1 299 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms