RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	LMF1	Q96S06	567 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SLC28A1	O00337	649 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DYRK3	O43781	588 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	AIFM1	O95831	613 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CHRNG	P07510	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	COX7A2	P14406	83 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	BTK	Q06187	659 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TLR1	Q15399	786 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TERF2	Q15554	542 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PSMF1	Q92530	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DGAT2	Q96PD7	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PCDH7	O60245	1069 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FGF17	O60258	216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GPR75	O95800	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	F10	P00742	488 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SERPINE1	P05121	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ARG2	P78540	354 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FOLH1	Q04609	750 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MCM8	Q9UJA3	840 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	LRRTM2	O43300	516 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	RGS14	O43566	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OR10H2	O60403	315 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HSPA4L	O95757	839 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FGF4	P08620	206 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GRK2	P25098	689 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PIK3R1	P27986	724 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SOX11	P35716	441 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CLCN2	P51788	898 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MPP2	Q14168	576 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	KANK2	Q63ZY3	851 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ELP5	Q8TE02	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	VMP1	Q96GC9	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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