RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.08□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 EXO5Q9H790 373 aa13.08□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MOCS1Q9NZB8 636 aa13.08□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.08□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A088AWK7 358 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CASP2P42575 452 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 FNTAP49354 379 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 KCNJ2P63252 427 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 NTRK2Q16620 822 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 DCST1Q5T197 706 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 BICRALQ6AI39 1079 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 VASNQ6EMK4 673 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM64Q6YI46 380 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF441Q8N8Z8 693 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 BBOF1Q8ND07 529 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PBKQ96KB5 322 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 KCNC2Q96PR1 638 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 TBCDQ9BTW9 1192 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CNIH4Q9P003 139 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.07□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ANKRD33BA6NCL7 494 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SH3BGRLO75368 114 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACSL3O95573 720 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 LY6G6DO95868 133 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 HPNP05981 417 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 HSPA7P48741 367 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 KEAP1Q14145 624 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 RCN2Q14257 317 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR4D1Q15615 310 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 LACC1Q8IV20 430 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNF175Q8N4F7 328 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 UCN3Q969E3 161 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CFAP36Q96G28 342 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 FBXL20Q96IG2 436 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CAPS2Q9BXY5 557 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 EDARQ9UNE0 448 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC6A5Q9Y345 797 aa13.06□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CD8B2A6NJW9 211 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLCA1A8K7I4 914 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PIAS1O75925 651 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 HEXAP06865 529 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLCO1A2P46721 670 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC37A1P57057 533 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 DCAF7P61962 342 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SORDQ00796 357 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCDH1Q08174 1060 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXF2Q12947 444 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 TBCCQ15814 346 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 C18orf63Q68DL7 685 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MED12LQ86YW9 2145 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 LAS2Q8IYD9 372 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC22A8Q8TCC7 542 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACTRT1Q8TDG2 376 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 GNRHR2Q96P88 292 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 UGT2B28Q9BY64 529 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 DERL2Q9GZP9 239 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 WWTR1Q9GZV5 400 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 USF3Q68DE3 2245 aa13.04□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa13.04□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1W2PS29 197 aa13.04□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SDCCAG3-211ENST00000486441 STK16O75716 305 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms