RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf226A1L170 272 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGA10O75578 1167 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 DDAH2O95865 285 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CRYABP02511 175 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CHN1P15882 459 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 UQCRFS1P47985 274 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 HMGCS1Q01581 520 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ACSM2AQ08AH3 577 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 PCLAFQ15004 111 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SPIN4Q56A73 249 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ACSM2BQ68CK6 577 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC25A25Q6KCM7 469 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CROCCP2Q86T23 111 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ARMC10Q8N2F6 343 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 MDS2Q8NDY4 140 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJB8Q8NHS0 232 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 UCN3Q969E3 161 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM125Q96AQ2 219 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ACPTQ9BZG2 426 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPHQ9H3R5 247 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 OLAHQ9NV23 265 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 MCM8Q9UJA3 840 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SERTM1A2A2V5 107 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ERLIN1O75477 346 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SP1P08047 785 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35E2P0CK97 266 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 UROSP10746 265 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH3A1P30838 453 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 HLCSP50747 726 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SSR4P51571 173 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXA1P55317 472 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF844Q08AG5 666 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPKAPK3Q16644 382 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 C6orf163Q5TEZ5 329 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 HOMEZQ8IX15 550 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF321PQ8N8H1 164 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8K3Q8NH51 312 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF721Q8TF20 911 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 RIT1Q92963 219 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 TRMOQ9BU70 441 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 MYOTQ9UBF9 498 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKUB1A6NFN9 424 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 WWP2O00308 870 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDH7O60245 1069 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CBX6O95503 412 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINB3P29508 390 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 GALNSP34059 522 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH9A1P49189 494 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 XKP51811 444 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF4P78317 190 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 FHL5Q5TD97 284 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 PRR7Q8TB68 274 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 DOK4Q8TEW6 326 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ASB15Q8WXK1 588 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 APIPQ96GX9 242 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SVILO95425 2214 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA6L10A6NI86 522 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 A8MVJ9 347 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC25A12O75746 678 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2J2O76002 312 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 NEURL1O76050 574 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 MYZAPP0CAP1 466 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 EDN3P14138 238 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CREB1P16220 341 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 PORP16435 677 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVK-8P63133 956 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRED3Q2MJR0 410 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZGRF1Q86YA3 2104 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 SCMH1Q96GD3 660 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXL20Q96IG2 436 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZIM3Q96PE6 472 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms