RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 UMPSP11172 480 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 HSD17B1P14061 328 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ST6GAL1P15907 406 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CPN2P22792 545 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SLC5A2P31639 672 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ITGA1P56199 1179 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CYP4F2P78329 520 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SLC25A3Q00325 362 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 HYAL2Q12891 473 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GNA13Q14344 377 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PTGR1Q14914 329 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 AMZ1Q400G9 498 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 MTX3Q5HYI7 312 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PERM1Q5SV97 790 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 AAGABQ6PD74 315 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GK5Q6ZS86 529 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 JADE3Q92613 823 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GTF2H4Q92759 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 EXTL1Q92935 676 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NCLNQ969V3 563 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RCN3Q96D15 328 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PANX1Q96RD7 426 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BBS4Q96RK4 519 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CGREF1Q99674 301 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NDC1Q9BTX1 674 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 STRADBQ9C0K7 418 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ACTL8Q9H568 366 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NANOGQ9H9S0 305 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ADA2Q9NZK5 511 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 DAPP1Q9UN19 280 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ASB4Q9Y574 426 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM247A6NEH6 219 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 DUXAA6NLW8 204 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FBP2O00757 339 aa6.62□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 PDPK1O15530 556 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 AKAP10O43572 662 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 DYRK3O43781 588 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CTNSO60931 367 aa6.62□□□□□ -1.35
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SHQ1-207ENST00000475558 OR2B3O76000 313 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ONECUT2O95948 504 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 AGR2O95994 175 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 IFNA14P01570 189 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 FAM87AP0C7U9 286 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 JMJD7P0C870 316 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 LIPCP11150 499 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 LAMP1P11279 417 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 GPX2P18283 190 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 ITGAXP20702 1163 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 CAPN3P20807 821 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 UQCRC2P22695 453 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 TACR1P25103 407 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 HTR1EP28566 365 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1-207ENST00000475558 IL12AP29459 219 aa6.62□□□□□ -1.35
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