RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CD46P15529 392 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CYB561P49447 251 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 HLCSP50747 726 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 HMGCS1Q01581 520 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ASPHQ12797 758 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF321PQ8N8H1 164 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 C5orf34Q96MH7 638 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TAAR6Q96RI8 345 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SENP1Q9P0U3 644 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.51■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SERTM1A2A2V5 107 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CBX6O95503 412 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CREB1P16220 341 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 PIK3R1P27986 724 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SPIN4Q56A73 249 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM156Q8N614 296 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM178AQ8NBL3 297 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 OR4K14Q8NGD5 310 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 OR8K3Q8NH51 312 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF721Q8TF20 911 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SCMH1Q96GD3 660 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 FBXL20Q96IG2 436 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ART5Q96L15 291 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TRMOQ9BU70 441 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 KLHL1Q9NR64 748 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 OLAHQ9NV23 265 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 MYOTQ9UBF9 498 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 MCM8Q9UJA3 840 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf226A1L170 272 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SP1P08047 785 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLC35E2P0CK97 266 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH3A1P30838 453 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 RNF4P78317 190 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ACSM2AQ08AH3 577 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ACSM2BQ68CK6 577 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 OR5L2Q8NGL0 311 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 RIT1Q92963 219 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 APIPQ96GX9 242 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CNPPD1Q9BV87 410 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 HES7Q9BYE0 225 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.49■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 PCDH7O60245 1069 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A12O75746 678 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 OR2J2O76002 312 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 CRYABP02511 175 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV3-11P04433 115 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 UROSP10746 265 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 EDN3P14138 238 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SERPINB3P29508 390 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GALNSP34059 522 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SSR4P51571 173 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 XKP51811 444 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 IMPG1Q17R60 797 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZIM3Q96PE6 472 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLX1AQ9BQ83 275 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 MECRQ9BV79 373 aa18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PS29 197 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 HRKO00198 91 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 WWP2O00308 870 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TYROBPO43914 113 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 HK2P52789 917 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-8P63133 956 aa18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 RAE1P78406 368 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTPS1-206ENST00000470271 BTKQ06187 659 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms