RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ASRGL1Q7L266 308 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL29Q96CT2 875 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM4Q9C037 500 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PQ72 361 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2W5A6NFC9 320 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS4BO75351 444 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RRADP55042 308 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 POLE2P56282 527 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC13A2Q13183 592 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 BIKQ13323 160 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP1A4Q13733 1029 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SMU1Q2TAY7 513 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C18orf63Q68DL7 685 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf30Q96M34 536 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 AIFM1O95831 613 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 KITP10721 976 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DRD2P14416 443 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MAOAP21397 527 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPK1P28482 360 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EFNA3P52797 238 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4D2P58180 307 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SERTAD2Q14140 314 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TSLPQ969D9 159 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FCRL1Q96LA6 429 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EBPLQ9BY08 206 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 NUF2Q9BZD4 464 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf226A1L170 272 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PEX11AO75192 247 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6AP2O75787 350 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 HPP00738 406 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R50P59544 299 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 STX4Q12846 297 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TMED1Q13445 227 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TAF11Q15544 211 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LZICQ8WZA0 190 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C8orf44Q96CB5 159 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PSME2Q9UL46 239 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC42Q9Y546 428 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR75O95800 540 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT16P08779 473 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SFT2D3Q587I9 215 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms