RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0Y8X5 98 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN1A2O60476 641 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE9AO76083 593 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACVR2AP27037 513 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPC1P35052 558 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIM2P55344 173 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF425Q6IV72 752 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SZRD1Q7Z422 152 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D15Q8TC07 691 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TANKQ92844 425 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN32Q9NX65 697 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHCGQ9UBD6 479 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL4A2P08572 1712 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PR48 441 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANHXE9PGG2 379 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNB2O95067 398 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTSP30990 170 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.435e-7■□□□□ 10.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARFIP1P53367 373 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSNK2BP67870 215 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BNIP3Q12983 259 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFATC4Q14934 902 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPRG1LQ5T0D9 272 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS48Q7RTY5 328 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMIGO1Q86WK6 493 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SVOPQ8N4V2 548 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD9Q8NBP5 474 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNASE1L2Q92874 299 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35G5Q96KT7 338 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF556Q9HAH1 456 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6C2Q9NZP2 312 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.71■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARRDC5A6NEK1 342 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ISM1B1AKI9 464 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FFAR1O14842 300 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCL10O95999 233 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR12D1P0DN82 309 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBLP22681 906 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AQP6Q13520 282 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC81Q6ZN84 652 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHSA2Q719I0 299 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P3H2Q8IVL5 708 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND6BQ8NEG7 585 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4E2Q8NGC2 313 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCN9Q8WX39 176 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROX1Q92786 737 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALPK1Q96QP1 1244 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BBS4Q96RK4 519 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51I1Q9H343 314 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RX2Q9UBL9 471 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGRMC2O15173 223 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC28A2O43868 658 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GUCY1B2O75343 617 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACADMP11310 421 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU2F1P14859 743 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CERS1P27544 350 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSL1P33121 698 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MVKQ03426 396 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYPL1Q16563 259 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTF1Q16619 201 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL35Q6PF15 583 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RD3Q7Z3Z2 195 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAGAPQ8N103 731 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR92Q96MX6 357 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF607Q96SK3 696 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOT13Q9NPJ3 140 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDND1Q9NY35 253 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX7Q9UNH6 387 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.7■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NINQ8N4C6 2090 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM247A6NEH6 219 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AXIN1O15169 862 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMA7AO75326 666 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AIFM1O95831 613 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR4A1P22736 598 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFS1P28331 727 aa17.69■□□□□ 0.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNJ5P48544 419 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms