RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ALG5Q9Y673 324 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ENPP4Q9Y6X5 453 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LTBP2Q14767 1821 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DSPPQ9NZW4 1301 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TRBC2A0A5B9 178 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RECKO95980 971 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 URODP06132 367 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF763Q0D2J5 394 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 MADCAM1Q13477 382 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 IER5LQ5T953 404 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PAQR6Q6TCH4 344 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PLET1Q6UQ28 207 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGRP3Q8IV61 690 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PKP4Q99569 1192 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SATB2Q9UPW6 733 aa17.44■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PQ72 361 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ARRDC5A6NEK1 342 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KPNA5O15131 536 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX28O15482 410 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX14O95416 240 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMP1P01033 207 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB33AQ14088 237 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 HSDL2Q6YN16 418 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 COMMD6Q7Z4G1 85 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TAGAPQ8N103 731 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST14Q8NCH0 376 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 WBP1LQ9NX94 342 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN6O43657 245 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE9AO76083 593 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SOAT1P35610 550 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT1P36639 197 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP4F8P98187 520 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RBBP4Q09028 425 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS53Q2L4Q9 553 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SYTL3Q4VX76 610 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CRB2Q5IJ48 1285 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM201Q5SNT2 666 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DDI2Q5TDH0 399 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZVL8 140 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF767PQ75MW2 155 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CMTM8Q8IZV2 173 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 OXR1Q8N573 874 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PROKR2Q8NFJ6 384 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP97Q9P2B7 532 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 INSL5Q9Y5Q6 135 aa17.43■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 FFAR1O14842 300 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2B3O76000 313 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RHCEP18577 417 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP2K3P46734 347 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 C22orf42Q6IC83 251 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM40Q6P9F5 258 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SPERTQ8NA61 448 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A18Q96N87 628 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 UCK2Q9BZX2 261 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SH2B3Q9UQQ2 575 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 TGFB1P01137 390 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CKMP06732 381 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 FURINP09958 794 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 HLA-FP30511 346 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ETV3P41162 512 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LIM2P55344 173 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF91Q05481 1191 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 RNLSQ5VYX0 342 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CREB3L2Q70SY1 520 aa17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms