RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZNF607Q96SK3 696 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 NEURL2Q9BR09 285 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 EHD3Q9NZN3 535 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 IL9P15248 144 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CHMP24386 653 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLC15A1P46059 708 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CDK3Q00526 305 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SYT16Q17RD7 645 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TTLQ8NG68 377 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 Q96MT0 163 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 FZD3Q9NPG1 666 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 GPR83Q9NYM4 423 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.57■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 FAAHO00519 579 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CLEC3AO75596 197 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 GASTP01350 101 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 STSP08842 583 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 OSMP13725 252 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TGM1P22735 817 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ARFIP1P53367 373 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 F2RL3Q96RI0 385 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLITRK5O94991 958 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 GADD45AP24522 165 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ5P48544 419 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 RGS6P49758 472 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 LINC00471Q8N535 108 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM19Q96HH6 336 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TEX101Q9BY14 249 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SELENONQ9NZV5 590 aa22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PPV9 198 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM247A6NEH6 219 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 FFAR1O14842 300 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 NDUFS4O43181 175 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SERPINB7O75635 380 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 RNLSQ5VYX0 342 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 VITQ6UXI7 678 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MMP21Q8N119 569 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 UCK2Q9BZX2 261 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 LHX9Q9NQ69 397 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.55■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 BCHEP06276 602 aa22.54■■□□□ 1.2
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PMS1-205ENST00000409985 IFITM3Q01628 133 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ZNF45Q02386 682 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLX4IPQ5VYV7 408 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PLAG1Q6DJT9 500 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa22.54■■□□□ 1.2
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PMS1-205ENST00000409985 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.54■■□□□ 1.2
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PMS1-205ENST00000409985 KXD1Q9BQD3 176 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A19Q9HC21 320 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 KRBA1A5PL33 1030 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 HMGN4O00479 90 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ13O60928 360 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 GSSP48637 474 aa22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PRKCDQ05655 676 aa22.54■■□□□ 1.2
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