RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384723.1

RNU6-1104P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1104, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1104P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IKBIPQ70UQ0 350 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PIGWQ7Z7B1 504 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 AACSQ86V21 672 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 AMIGO1Q86WK6 493 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 C6orf223Q8N319 242 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ESX1Q8N693 406 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 OR10H4Q8NGA5 316 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 OR6X1Q8NH79 312 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 C16orf58Q96GQ5 468 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TTYH2Q9BSA4 534 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CNPY3Q9BT09 278 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ULBP2Q9BZM5 246 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DPEP2Q9H4A9 486 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GLIPR2Q9H4G4 154 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 APMAPQ9HDC9 416 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 WASH6PQ9NQA3 447 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GGA3Q9NZ52 723 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MLXQ9UH92 298 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TEX264Q9Y6I9 313 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NKX2-6A6NCS4 301 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 A6NLC8 198 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 G3V3Y1 287 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 OR7A17O14581 309 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SLC25A27O95847 323 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NUDT14O95848 222 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GSRP00390 522 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GOT2P00505 430 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IGHG3P01860 377 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LYNP07948 512 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MMP10P09238 476 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LINGO3P0C6S8 592 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZCCHC18P0CG32 403 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ADRB3P13945 408 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CD59P13987 128 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 HADHAP40939 763 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CCT5P48643 541 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 POU3F4P49335 361 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TUBP50607 506 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MNAT1P51948 309 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ARHGDIBP52566 201 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MFAP2P55001 183 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 UBASH3AP57075 661 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NUP107P57740 925 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ACTA2P62736 377 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ACTC1P68032 377 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 UBXN2AP68543 259 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MAMLD1Q13495 774 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PPA1Q15181 289 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SNAPC1Q16533 368 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IQCCQ4KMZ1 466 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SPIN3Q5JUX0 258 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 COX8CQ7Z4L0 72 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF429Q86V71 674 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ZNF100Q8IYN0 542 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SAMD3Q8N6K7 520 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CAMKVQ8NCB2 501 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 IL17REQ8NFR9 667 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GRK7Q8WTQ7 553 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 LPGAT1Q92604 370 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PYCR2Q96C36 320 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TSNARE1Q96NA8 513 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 Q9H3A6 140 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SNX25Q9H3E2 840 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MUC13Q9H3R2 512 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TMOD3Q9NYL9 352 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 TBC1D7Q9P0N9 293 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SEC14L4Q9UDX3 406 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 RNF150Q9ULK6 438 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 SH3GLB1Q9Y371 365 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 DGKBQ9Y6T7 804 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 ATRQ13535 2644 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 CEP295Q9C0D2 2601 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 E5RGE8 158 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1104P-201ENST00000384723 H3BMM5 538 aa0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms