RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A0J9YXY3 114 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H3BRN7 92 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDPK1O15530 556 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPPAP01160 153 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDGFRAP16234 1089 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BTDP43251 543 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GSTO1P78417 241 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RIPK1Q13546 671 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAF5Q15542 800 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC5A9Q2M3M2 681 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RABGAP1LQ5R372 815 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCTD16Q68DU8 428 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UGT3A1Q6NUS8 523 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PGM2L1Q6PCE3 622 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR59Q6PJI9 974 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R27Q86WC6 154 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHD1LQ86WJ1 897 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPBP1Q86WP2 473 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCSAMQ8N6F7 178 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM86B1Q8N7N1 296 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ETNPPLQ8TBG4 499 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF139Q8WU17 664 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL4I1Q96RQ9 567 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SIN3AQ96ST3 1273 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOL5Q9BWW9 433 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP44Q9H0E7 712 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNMDQ9H2S6 317 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DPEP2Q9H4A9 486 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARFGAP3Q9NP61 516 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BABAM2Q9NXR7 383 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPHK1Q9NYA1 384 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD274Q9NZQ7 290 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF222Q9UK12 451 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CARD8Q9Y2G2 431 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADGRB3O60242 1522 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSMB11A5LHX3 300 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AGAP14A8MT82 685 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A8MUI8 341 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FXYD1O00168 92 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MBD4O95243 580 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MLYCDO95822 493 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DPP4P27487 766 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRKCIP41743 596 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIK3CBP42338 1070 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC1A6P48664 564 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HCCSP53701 268 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDK18Q07002 472 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTK6Q13882 451 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT31Q15323 416 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CST6Q15828 149 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ECSCRQ19T08 205 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF569Q5MCW4 686 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAXCQ5TGI0 409 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 METTL11BQ5VVY1 283 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAA35Q5VZE5 725 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC30A6Q6NXT4 461 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLEC4GQ6UXB4 293 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COX15Q7KZN9 410 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MICU3Q86XE3 530 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UNC5CLQ8IV45 518 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GHDCQ8N2G8 530 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF283Q8N7M2 679 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DENND6BQ8NEG7 585 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STEAP2Q8NFT2 490 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLEC4CQ8WTT0 213 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLAC4Q8WY50 150 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NEIL2Q969S2 332 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MUL1Q969V5 352 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TIMM29Q9BSF4 260 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EHD2Q9NZN4 543 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OSGIN1Q9UJX0 560 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSF4Q9ULV5 492 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DDX19BQ9UMR2 479 aa-2.54□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms