RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHUKO15111 745 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP9AO75110 1047 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFNAR1P17181 557 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLRA1P23415 457 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVPABLB-1P60509 514 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKCEQ02156 737 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAX2Q02962 417 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCP2Q13094 533 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCAF12Q5T6F0 453 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 AQP12AQ8IXF9 295 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ULK4Q96C45 1275 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCT8L2Q96SF2 557 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF559Q9BR84 538 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAXXQ9BUH6 204 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SENP1Q9P0U3 644 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC14L4Q9UDX3 406 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIMAP2Q9UG22 337 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087X0K7 114 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFCAB7A8K855 629 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPAA1O43292 621 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRCPO75575 148 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 LYPD3O95274 346 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLU7O95391 586 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT6AP02538 564 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT6BP04259 564 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASTP20810 708 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKAR2BP31323 418 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1D2P34982 312 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFRSF4P43489 277 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT6CP48668 564 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGDIAP52565 204 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDST1P52848 882 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CXCL6P80162 114 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GABPAQ06546 454 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTK6Q13882 451 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA0040Q15053 153 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 WSCD2Q2TBF2 565 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 UNC50Q53HI1 259 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MPP7Q5T2T1 576 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC38Q5VT99 294 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM47EQ6ZV65 393 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 OTOAQ7RTW8 1153 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf64Q86WR6 236 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBQLNLQ8IYU4 475 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXW8Q8N3Y1 598 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4F5Q8NH21 305 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA5Q8TBA6 731 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CORO2AQ92828 525 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERP27Q96DN0 273 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB3CQ96E17 227 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEB18Q96M61 343 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC114Q96M63 670 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERINC2Q96SA4 455 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTYH2Q9BSA4 534 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDF3Q9NR23 364 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLSCR3Q9NRY6 295 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXL5Q9UKA1 691 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK-19Q9WJR5 959 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITM2BQ9Y287 266 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 OOEPA6NGQ2 149 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 APBB3O95704 486 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOT2P00505 430 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPOP01588 193 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEB1P43366 347 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC7A2P52569 658 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFAP2P55001 183 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP1Q07960 439 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC10A1Q14973 349 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 P2RY14Q15391 338 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ISXQ2M1V0 245 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf189Q5VU69 101 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZRG5 221 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR49Q8IV35 697 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRPV3Q8NET8 790 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms