RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 CALHM3Q86XJ0 350 aa25.25■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 PYDC1Q8WXC3 89 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 RNH1P13489 461 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 FOLH1Q04609 750 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 ABHD18Q0P651 414 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 SPPL2CQ8IUH8 684 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 MAGED4Q96JG8 741 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 PRRX2Q99811 253 aa25.25■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 ENAMQ9NRM1 1142 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 ACTR3BQ9P1U1 418 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 CORO2BQ9UQ03 480 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.25■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 ELOVL7A1L3X0 281 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 C4orf47A7E2U8 309 aa25.24■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 CRATP43155 626 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 COX20Q5RI15 118 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 SZRD1Q7Z422 152 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 COL26A1Q96A83 441 aa25.24■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 PRDM9Q9NQV7 894 aa25.24■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 H0YIG0 161 aa25.24■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 RNF130Q86XS8 419 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 OR9A2Q8NGT5 310 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 TANKQ92844 425 aa25.24■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 GLYATQ6IB77 296 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 SERPINA11Q86U17 422 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 MICU2Q8IYU8 434 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 TNIP2Q8NFZ5 429 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 OR51Q1Q8NH59 317 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 FIG4Q92562 907 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 YIPF2Q9BWQ6 316 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 TRIM15Q9C019 465 aa25.23■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 MUC13Q9H3R2 512 aa25.23■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 KRT75O95678 551 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 C1orf189Q5VU69 101 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 TMEM107Q6UX40 140 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 PSMA8Q8TAA3 256 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 B4GALT2O60909 372 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 KCNK5O95279 499 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 NUDT7P0C024 238 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 MVDP53602 400 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 ARSFP54793 590 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 TP53BP2Q13625 1128 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 FXNQ16595 210 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 LCN8Q6JVE9 175 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 OR52N2Q8NGI0 321 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa25.22■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 S100A14Q9HCY8 104 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 OCIAD1Q9NX40 245 aa25.22■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 ADAMTS20P59510 1910 aa25.21■■□□□ 1.63
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MSX1-201ENST00000382723 GPR75O95800 540 aa25.21■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 CPMP14384 443 aa25.21■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 PORP16435 677 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 XCR1P46094 333 aa25.21■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.21■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 SAXO2Q658L1 398 aa25.21■■□□□ 1.63
MSX1-201ENST00000382723 C6orf120Q7Z4R8 191 aa25.21■■□□□ 1.63
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