RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368507.7

ROS1-201, Transcript of ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ROS1, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1-201ENST00000368507 GRB7Q14451 532 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NTRK3Q16288 839 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CDKN3Q16667 212 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 UTS2BQ765I0 119 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MON1BQ7L1V2 547 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DPY19L4Q7Z388 723 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR5B2Q96R09 309 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PSD2Q9BQI7 771 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF442Q9H7R0 627 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CD93Q9NPY3 652 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NANSQ9NR45 359 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DHDHQ9UQ10 334 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 A0A1B0GVG6 124 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF860A6NHJ4 632 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CCL22O00626 93 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 IFNA5P01569 189 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NDUFV2P19404 249 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CDONQ4KMG0 1287 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR4N5Q8IXE1 308 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OSTF1Q92882 214 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RNF39Q9H2S5 420 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FNIP2Q9P278 1114 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CAPN8A6NHC0 703 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 COCHO43405 550 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ENTPD6O75354 484 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SBK2P0C263 348 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TIMP2P16035 220 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TAS2R40P59535 323 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DEFA5Q01523 94 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TPRA1Q86W33 373 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LRFN1Q9P244 771 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 COPZ2Q9P299 210 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.9□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLC7A4O43246 635 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PLATP00750 562 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MAGEA11P43364 429 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 EMP2P54851 167 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 IRF9Q00978 393 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLC3A1Q07837 685 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MPPED2Q15777 294 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 POC1BQ8TC44 478 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C7orf26Q96N11 449 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF559Q9BR84 538 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PPLO60437 1756 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PRAMEF2O60811 474 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms