RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 LRIT2A6NDA9 550 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 KCNJ13O60928 360 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 BCL6P41182 706 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TCEA2Q15560 299 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 INAQ16352 499 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ADCK1Q86TW2 530 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 NEURL3Q96EH8 262 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 KLHL31Q9H511 634 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 OSGIN1Q9UJX0 560 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 RNF6Q9Y252 685 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 NINQ8N4C6 2090 aa21.45■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 LCKP06239 509 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 CD36P16671 472 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 HTR4Q13639 388 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SAXO2Q658L1 398 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ZNF793Q6ZN11 406 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 FBXL6Q8N531 539 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 HORMAD2Q8N7B1 307 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ADAM29Q9UKF5 820 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 RAB23Q9ULC3 237 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 CA5BQ9Y2D0 317 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TRBC2A0A5B9 178 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PRSS38A1L453 326 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 KRBA1A5PL33 1030 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TNFRSF11BO00300 401 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ADAMDEC1O15204 470 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PRAMEF10O60809 474 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 B4GALT2O60909 372 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SSR2P43308 183 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TRIM73Q86UV7 250 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 NATD1Q8N6N6 113 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SLC38A4Q969I6 547 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ITPAQ9BY32 194 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 NEUROD4Q9HD90 331 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa21.44■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 A0A0A6YYD5 115 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 H0Y8X5 98 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 GGT2P36268 569 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 OR52J3Q8NH60 311 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PDXPQ96GD0 296 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 FBRSQ9HAH7 460 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 WASHC1A8K0Z3 465 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 J3KTA2 159 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 HAT1O14929 419 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TGM1P22735 817 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 GPR153Q6NV75 609 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 P3H2Q8IVL5 708 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TTLQ8NG68 377 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 OR2L3Q8NG85 312 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 FEVQ99581 238 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 COPS4Q9BT78 406 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 DPH7Q9BTV6 452 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 THSD1Q9NS62 852 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 FKBP14Q9NWM8 211 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 CLDND1Q9NY35 253 aa21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TMEM247A6NEH6 219 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 C4orf51C9J302 202 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 EML2O95834 649 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 IFNA14P01570 189 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 HYAL2Q12891 473 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 PERM1Q5SV97 790 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 REEP3Q6NUK4 255 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 OR2M4Q96R27 311 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.42■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ALOX5P09917 674 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 CDH12P55289 794 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SPIBQ01892 262 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 ZIC1Q15915 447 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 DUSP7Q16829 419 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 OR4C15Q8NGM1 316 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 RHOXF1Q8NHV9 184 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LDB1-201ENST00000361198 KCNC2Q96PR1 638 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms