RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MUS81Q96NY9 551 aa16.89■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 THADAQ6YHU6 1953 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 NINQ8N4C6 2090 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 CTSBP07858 339 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 ALOX12P18054 663 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 MPIP34949 423 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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