RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DNLZQ5SXM8 178 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF383Q8NA42 475 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ITFG1Q8TB96 612 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NXNL1Q96CM4 212 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MYO19Q96H55 970 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF479Q96JC4 524 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 INTS14Q96SY0 518 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 POT1Q9NUX5 634 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MARK1Q9P0L2 795 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NCDNQ9UBB6 729 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM74A7A6NL05 159 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CLDN5O00501 218 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PTGESO14684 152 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MID1O15344 667 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 OR10H2O60403 315 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RAD1O60671 282 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PRAMEF2O60811 474 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RFPL3O75679 317 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 B3GAT3O94766 335 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PPBPP02775 128 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RAF1P04049 648 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TPOP07202 933 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RD3LP0DJH9 198 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TPH1P17752 444 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CD52P31358 61 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PTGFRP43088 359 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ALDH3B1P43353 468 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LIMS1P48059 325 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CLDN8P56748 225 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 BLOC1S1P78537 153 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 POU4F2Q12837 409 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DUSP8Q13202 625 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SLAMF1Q13291 335 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GBX1Q14549 363 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 OR8G1Q15617 311 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MROH9Q5TGP6 573 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SPESP1Q6UW49 350 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PIGZQ86VD9 579 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SENP8Q96LD8 212 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PEBP4Q96S96 227 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DPH7Q9BTV6 452 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MRI1Q9BV20 369 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMED9Q9BVK6 235 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RNF32Q9H0A6 362 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NANSQ9NR45 359 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 AAASQ9NRG9 546 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TCFL5Q9UL49 500 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SLC5A10A0PJK1 596 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 URADA6NGE7 173 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ARL5CA6NH57 179 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 E9PI62 339 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 IGHEP01854 428 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CSF2P04141 144 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms