RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CYC1P08574 325 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ITGAMP11215 1152 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 XKP51811 444 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 POLE2P56282 527 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 BTBD16Q32M84 506 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF385BQ569K4 471 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF681Q96N22 645 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 DDAH2O95865 285 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 CT62P0C5K7 136 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 DDCP20711 480 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ITGA3P26006 1051 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 GPR143P51810 404 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PGDP52209 483 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SLC26A5P58743 744 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 LY6DQ14210 128 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 LTB4RQ15722 352 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CGB2Q6NT52 195 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 GALNT16Q8N428 558 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 FAIM2Q9BWQ8 316 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 GABRR3A8MPY1 467 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 C17orf105B2RV13 164 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 C9JVG2 144 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CPMP14384 443 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 DRD2P14416 443 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PIK3R1P27986 724 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 STT3AP46977 705 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 IDH3AP50213 366 aa8.48□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 AQP5P55064 265 aa8.48□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 SERTAD2Q14140 314 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 NXNQ6DKJ4 435 aa8.48□□□□□ -1.05
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PDE4D-201ENST00000309641 EPGNQ6UW88 154 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-201ENST00000309641 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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