RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 GABRR2P28476 465 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DDOSTP39656 456 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MAPK12P53778 367 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 IQCHQ86VS3 1027 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MSANTD3Q96H12 275 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G10O15496 165 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 IGSF6O95976 241 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RBBP4Q09028 425 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TEAD4Q15561 434 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 GPR19Q15760 415 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 BBS10Q8TAM1 723 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 OR4K3Q96R72 315 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PRKACBP22694 351 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PTSQ03393 145 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 VEZF1Q14119 521 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CASD1Q96PB1 797 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 STUB1Q9UNE7 303 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 H7C0S8 307 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CRYBB2P43320 205 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CDH24Q86UP0 819 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 OR52E4Q8NGH9 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 KCTD7Q96MP8 289 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 NR2F6P10588 404 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RRM2BQ7LG56 351 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 KLK6Q92876 244 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DEFB118Q96PH6 123 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 NLNQ9BYT8 704 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 CNIH4Q9P003 139 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 YIPF1Q9Y548 306 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FGFBP1Q14512 234 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZMYND11Q15326 602 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MACC1Q6ZN28 852 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TMC8Q8IU68 726 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ING3Q9NXR8 418 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ANGPT4Q9Y264 503 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ITM2BQ9Y287 266 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FAM183AA6NL82 134 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 HOXD10P28358 340 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 DSTNP60981 165 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 LMAN2Q12907 356 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms