RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.64■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 HMGN4O00479 90 aa22.63■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 P2RX6O15547 441 aa22.63■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE9AO76083 593 aa22.63■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.63■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PVRP15151 417 aa22.63■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22.63■■□□□ 1.21
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RPUSD1-201ENST00000007264 FHP07954 510 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGAMP11215 1152 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 MAOBP27338 520 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEA8P43361 318 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM107Q6UX40 140 aa22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5D16Q8NGK9 328 aa22.6■■□□□ 1.21
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