RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 NTN1O95631 604 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NPPBP16860 134 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RHCEP18577 417 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CNTN1Q12860 1018 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MPPE1Q53F39 396 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 DCST1Q5T197 706 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 KRT73Q86Y46 540 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PHC2Q8IXK0 858 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NPIPB8E9PQR5 432 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 M0R3H8 397 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 DPM1O60762 260 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ABLIM3O94929 683 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SCN1BQ07699 218 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HYAL2Q12891 473 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 INSL4Q14641 139 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TCTN3Q6NUS6 607 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TTC23LQ6PF05 361 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GDPD4Q6W3E5 623 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM19Q96HH6 336 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SEMA3GQ9NS98 782 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 A0A0B4J293 547 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PIPSLA2A3N6 862 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SLC16A5O15375 505 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 UGDHO60701 494 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NCR1O76036 304 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 POP4O95707 220 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CSF3P09919 207 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ALPPL2P10696 532 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ETV5P41161 510 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ETV6P41212 452 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ETV1P50549 477 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GRIN2CQ14957 1233 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CCDC58Q4VC31 144 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SYCE2Q6PIF2 218 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FIBINQ8TAL6 211 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RNF31Q96EP0 1072 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 YIPF4Q9BSR8 244 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SPATA9Q9BWV2 254 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MIXL1Q9H2W2 232 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 BRF2Q9HAW0 419 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 KLHL18O94889 574 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 IFNA14P01570 189 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PSKH1P11801 424 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GPC1P35052 558 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 GSTM5P46439 218 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 LIMS1P48059 325 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SIX5Q8N196 739 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 FOPNLQ96NB1 174 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NLNQ9BYT8 704 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 KCNK12Q9HB15 430 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 IL21Q9HBE4 155 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 STUB1Q9UNE7 303 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 SH3D21A4FU49 640 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 NPC1O15118 1278 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 CHRNB1P11230 501 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 OSMP13725 252 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 MYL9P24844 172 aa14.99□□□□□ -0.01
NPHP4-211ENST00000622020 PRKAG1P54619 331 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms