RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 E2F1Q01094 437 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 RTP5Q14D33 572 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PAGE2Q7Z2X7 111 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR156Q8NFN8 814 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K1Q8NGD4 311 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF566Q969W8 418 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 MPP4Q96JB8 637 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 DOK1Q99704 481 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3GL3Q99963 347 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM29Q9UKF5 820 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ACACAQ13085 2346 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMUO75648 421 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFALSP35858 605 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 REEP5Q00765 189 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNAB2Q13303 367 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 KEAP1Q14145 624 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM40Q6P9F5 258 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9B2Q86UD5 537 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SMURF2Q9HAU4 748 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WV48 116 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CLIC3O95833 236 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PCCBP05166 539 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC159P0C7I6 412 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ALPPL2P10696 532 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ETS2P15036 469 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CALRP27797 417 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTM2P28161 218 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 DAB2P98082 770 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf80Q0P641 193 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SPIDRQ14159 915 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 DEPDC1Q5TB30 811 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF691Q5VV52 312 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AR1Q8NGP9 310 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NXPE2Q96DL1 559 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 EPYCQ99645 322 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR26Q9H7D7 661 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CIDEBQ9UHD4 219 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SUV39H1O43463 412 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 HS6ST1O60243 411 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCB7O75027 752 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFRSF21O75509 655 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP9O95302 570 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNA14P01570 189 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MYF5P13349 255 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A2P31639 672 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 SHMT2P34897 504 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR8P51685 355 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 YPEL5P62699 121 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF385BQ569K4 471 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf141Q5SZD1 244 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 GCNT6Q5T4J0 391 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM4DQ6B0I6 523 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 HSH2DQ96JZ2 352 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 DOHHQ9BU89 302 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R9Q9NYW1 312 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 UTS2RQ9UKP6 389 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS20P59510 1910 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TGFB1P01137 390 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 JUNDP17535 347 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 CRHBPP24387 322 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBP5P24593 272 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 DCKP27707 260 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFIP1P53367 373 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MVDP53602 400 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCR4P61073 352 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 GAB1Q13480 694 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF347Q96SE7 839 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MENTQ9BUN1 341 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A8Q9BY19 250 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms