RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFU1Q9UMS0 254 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLOD5A6NK44 160 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 E9PLN8 166 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 K7EPI3 171 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HRKO00198 91 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 EBAG9O00559 213 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTNSO60931 367 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 KERAO60938 352 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ETHE1O95571 254 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CELA3AP09093 270 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTA2P09210 222 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL3P10147 92 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPB42P16452 691 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRABP2P29373 138 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIGAP37287 484 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CORO7P57737 925 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF4P78317 190 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASPHQ12797 758 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFKFB4Q16877 469 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTMPQ5BVD1 217 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 C18orf63Q68DL7 685 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHSY3Q70JA7 882 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISCA2Q86U28 154 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2M7Q8NG81 312 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARL8AQ96BM9 186 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCYL1Q96KG9 808 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LURAP1Q96LR2 239 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DGAT2Q96PD7 388 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB17Q9H0T7 212 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACTR8Q9H981 624 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LYRM4Q9HD34 91 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX15Q9NRS6 342 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYOTQ9UBF9 498 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACOT9Q9Y305 439 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPACA6W5XKT8 324 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLQO75417 2590 aa6.65□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 APCP25054 2843 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PS29 197 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACOT7O00154 380 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLPP1O14494 284 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP6AP2O75787 350 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 GBAP04062 536 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2P06681 752 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM153BP0C7A2 387 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTHFD2P13995 350 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 COX7A2P14406 83 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTGER4P35408 488 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEA5P43359 124 aa6.64□□□□□ -1.35
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