RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FRG2B	Q96QU4	278 aa		20.22	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		20.22	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		20.22	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	20.22	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA1D	Q01668	2161 aa		20.22	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PR48	441 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MT66	165 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP6C	O00743	305 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA3D	O95025	777 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	MLYCD	O95822	493 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3-11	P04433	115 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	TNNI3	P19429	210 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	HK2	P52789	917 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF4	P78317	190 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	FOLH1	Q04609	750 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	BIK	Q13323	160 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	LGSN	Q5TDP6	509 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SULF2	Q8IWU5	870 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	RASL10B	Q96S79	203 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	FETUB	Q9UGM5	382 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		20.21	■□□□□ 0.83
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ASNA1	O43681	348 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF24	P17028	368 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	RBPJ	Q06330	500 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC29A2	Q14542	456 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT13	Q86X67	352 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINI1	Q99574	410 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF225	Q9UK10	706 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	LRBA	P50851	2863 aa		20.2	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	WWP2	O00308	870 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX1	O43933	1283 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6B1	O95007	311 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MEOX1	P50221	254 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MZB1	Q8WU39	189 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	DGAT2	Q96PD7	388 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	HRK	O00198	91 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR75	O95800	540 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	COX7A2	P14406	83 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	DCT	P40126	519 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX3	P41225	446 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH13	P55290	713 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	C3AR1	Q16581	482 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	LCA5	Q86VQ0	697 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	UCN3	Q969E3	161 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC120	Q96HB5	630 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	DEPP	Q9NTK1	212 aa		20.19	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MVJ9	347 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL21	O00585	134 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	AIFM1	O95831	613 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	OTC	P00480	354 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GBA	P04062	536 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	NR2F6	P10588	404 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	HERVK_113	P63132	956 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PLIN5	Q00G26	463 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	GHDC	Q8N2G8	530 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	NUBPL	Q8TB37	319 aa		20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	20.18	■□□□□ 0.82
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB15	Q8WXK1	588 aa		20.18	■□□□□ 0.82

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