RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SPRY4Q9C004 299 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ACTL8Q9H568 366 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 APMAPQ9HDC9 416 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KCND3Q9UK17 655 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.78□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C9orf172C9J069 976 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 NR5A2O00482 541 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PDPK1O15530 556 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 AKAP10O43572 662 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 LRATO95237 230 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 KCNH1O95259 989 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CTSBP07858 339 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 KRT16P08779 473 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SLC35E2P0CK97 266 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 COX4I1P13073 169 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ITIH1P19827 911 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SHC2P98077 582 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PLIN5Q00G26 463 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ART3Q13508 389 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CEBPEQ15744 281 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 UGT8Q16880 541 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C1orf189Q5VU69 101 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DPP10Q8N608 796 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PEX11GQ96HA9 241 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MARK4Q96L34 752 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CCDC115Q96NT0 180 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C1orf21Q9H246 121 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ARMCX1Q9P291 453 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRB8 838 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 B4GALT2O60909 372 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MED26O95402 600 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TIAF1O95411 115 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 RECKO95980 971 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ATP1B1P05026 303 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 HEXBP07686 556 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 LAMP1P11279 417 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 CPMP14384 443 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SLC5A2P31639 672 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ETV5P41161 510 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 XKP51811 444 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 NME5P56597 212 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 AP2B1P63010 937 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 OLR1P78380 273 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 NCF4Q15080 339 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 NKG7Q16617 165 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SPATS1Q496A3 300 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 SPANXN4Q5MJ08 99 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C18orf63Q68DL7 685 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 C16orf89Q6UX73 402 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-220ENST00000550700 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms