RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550407.1

TARBP2-215, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-215	ENST00000550407	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TSSK3	Q96PN8	268 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	EBAG9	O00559	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TMPRSS11D	O60235	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ALB	P02768	609 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	UMOD	P07911	640 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	DRD2	P14416	443 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	IL1RN	P18510	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ALAS2	P22557	587 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TACR1	P25103	407 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CERS1	P27544	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PRDX6	P30041	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TAS2R50	P59544	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	UFM1	P61960	85 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PTGR1	Q14914	329 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	AGK	Q53H12	422 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CPZ	Q66K79	652 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	GPR180	Q86V85	440 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	AMER3	Q8N944	861 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	TESC	Q96BS2	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	WDR54	Q9H977	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	DAPP1	Q9UN19	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ASB4	Q9Y574	426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	FAM234B	A2RU67	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CAPN14	A8MX76	684 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SGK494	L7N484	410 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PROM1	O43490	865 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	B3GALT4	O96024	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CD63	P08962	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PIK3R1	P27986	724 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	HPCAL1	P37235	193 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	LIM2	P55344	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	NME5	P56597	212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	FOXL2	P58012	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	KLC1	Q07866	573 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RUNX2	Q13950	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SPSB2	Q99619	263 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	C1orf226	A1L170	272 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	BLACE	A4D250	179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-215	ENST00000550407	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms