RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 IRF8Q02556 426 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PDK4Q16654 411 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PRAMEF20Q5VT98 475 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SULT1C3Q6IMI6 304 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 NUBPLQ8TB37 319 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 WDR34Q96EX3 536 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 KRT12Q99456 494 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CD274Q9NZQ7 290 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 DYRK3O43781 588 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 FGF17O60258 216 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 TGFB1P01137 390 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CCDC166P0CW27 439 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 DNASE1P24855 282 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SSR2P43308 183 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 STT3AP46977 705 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 POU4F1Q01851 419 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CHIT1Q13231 466 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CHSY3Q70JA7 882 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 C9orf40Q8IXQ3 194 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 LIX1Q8N485 282 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PAQR8Q8TEZ7 354 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 MS4A8Q9BY19 250 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SH2D2AQ9NP31 389 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 RASSF1Q9NS23 344 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 EDARQ9UNE0 448 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 HSPB2A8KAH6 182 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SYT5O00445 386 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PIAS1O75925 651 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PCNAP12004 261 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CD1DP15813 335 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PEX19P40855 299 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SLAMF1Q13291 335 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 OR4D1Q15615 310 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 HSPB2Q16082 182 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SLC15A4Q8N697 577 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 FAM13CQ8NE31 585 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 DOK4Q8TEW6 326 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 EXT2Q93063 718 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 LRRC46Q96FV0 321 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ART5Q96L15 291 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 TRIM31Q9BZY9 425 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 AKAP6Q13023 2319 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-214ENST00000548849 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 HRKO00198 91 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 DVL2O14641 736 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 IGKV3-11P04433 115 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 BMP5P22003 454 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 TRPC1P48995 793 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 DGKQP52824 942 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 ATP6V0D1P61421 351 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 DR1Q01658 176 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 BIKQ13323 160 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 TBCCQ15814 346 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 MED27Q6P2C8 311 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 LYPD8Q6UX82 237 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 CDC20BQ86Y33 519 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 PDPRQ8NCN5 879 aa15.64■□□□□ 0.09
CS-214ENST00000548849 BBOF1Q8ND07 529 aa15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms