RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	FAM168A	Q92567	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	HBEGF	Q99075	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	LHPP	Q9H008	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PCM1	Q15154	2024 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0A6YYD5	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1W2PR48	441 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PGRMC2	O15173	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	FGF17	O60258	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	LDB3	O75112	727 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	MYO1D	O94832	1006 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	CBX6	O95503	412 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	IGHE	P01854	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	CLPS	P04118	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	CD63	P08962	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	GFAP	P14136	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	MST1	P26927	711 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ARRB2	P32121	409 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	HTR6	P50406	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SERPINB9	P50453	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	RAB38	P57729	211 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	OR4D2	P58180	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SLC26A5	P58743	744 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP2	Q05923	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	MFAP5	Q13361	173 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ABHD13	Q7L211	337 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-234	ENST00000546048	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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