RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	THYN1	Q9P016	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309		K7EQG2	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	HSF2BP	O75031	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SERPINF2	P08697	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	STMN1	P16949	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	GEM	P55040	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	GPR137	Q96N19	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ATF6B	Q99941	703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309		A0A1B0GU03	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SYCE3	A1L190	88 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PDHX	O00330	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CHEK1	O14757	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ANXA9	O76027	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MS4A2	Q01362	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PAX8	Q06710	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RAPSN	Q13702	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309		Q6ZRG5	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CARD9	Q9H257	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ID1	P41134	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SLC1A6	P48664	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	PITPNB	P48739	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	LIMK2	P53671	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CCZ1B	P86790	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CD300C	Q08708	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	P2RY14	Q15391	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	TRADD	Q15628	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASP4-208	ENST00000530309	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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