RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525081.1

NSD3-204, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,581 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-204	ENST00000525081	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SPACA6	W5XKT8	324 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	HMX2	A2RU54	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ACOT7	O00154	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	PLPP1	O14494	284 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	IGKV3-11	P04433	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CELA3A	P09093	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CCL3	P10147	92 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	EPB42	P16452	691 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CNR1	P21554	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SERPINB1	P30740	379 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	STX2	P32856	288 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	STT3A	P46977	705 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	DNASE1L1	P49184	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	FOLH1	Q04609	750 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	PMPCA	Q10713	525 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	FOXO1	Q12778	655 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	C18orf63	Q68DL7	685 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GK5	Q6ZS86	529 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SGCZ	Q96LD1	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	C2	P06681	752 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	COX7A2	P14406	83 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CHRNB4	P30926	498 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	PIGA	P37287	484 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RAP1GDS1	P52306	607 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	NUP107	P57740	925 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TNFRSF17	Q02223	184 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CAV1	Q03135	178 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TLE4	Q04727	773 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TFF3	Q07654	80 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	MPEG1	Q2M385	716 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	OPN5	Q6U736	354 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GPR180	Q86V85	440 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RND1	Q92730	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RGMA	Q96B86	450 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	DGAT2	Q96PD7	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GLOD5	A6NK44	160 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	SYCE1L	A8MT33	242 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	EED	O75530	441 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	TOX	O94900	526 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	IGHG3	P01860	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081		P04436	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	GFAP	P14136	432 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NSD3-204	ENST00000525081	IGFBP2	P18065	325 aa		10.11	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms