RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519534.1

CHTF8-206, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, human

TSL 2

Gene CHTF8, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF8-206	ENST00000519534	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	EBF4	Q9BQW3	602 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHTF8-206	ENST00000519534	SPTBN2	O15020	2390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ADAMTS20	P59510	1910 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	GABRR3	A8MPY1	467 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	PGRMC2	O15173	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	B4GALT2	O60909	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	SLC22A3	O75751	556 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	IL6	P05231	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	UMOD	P07911	640 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	LIF	P15018	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	F8A1	P23610	371 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	PIK3R1	P27986	724 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	HPCAL1	P37235	193 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	XK	P51811	444 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	AP2B1	P63010	937 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	STX4	Q12846	297 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	SLC13A2	Q13183	592 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	TGIF1	Q15583	401 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CPTP	Q5TA50	214 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	PROSER1	Q86XN7	944 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	RAB43	Q86YS6	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MIER2	Q8N344	545 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	FAM47B	Q8NA70	645 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	EGLN2	Q96KS0	407 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	TSSK3	Q96PN8	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	DPY30	Q9C005	99 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CLMP	Q9H6B4	373 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	KLK10	O43240	276 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	DYRK3	O43781	588 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ATP1B1	P05026	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CPM	P14384	443 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	STT3A	P46977	705 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	SOX8	P57073	446 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	STX1B	P61266	288 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	BTG2	P78543	158 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	FOLH1	Q04609	750 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ERV3-1	Q14264	604 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	SQLE	Q14534	574 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	PTGR1	Q14914	329 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	BROX	Q5VW32	411 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	MORN4	Q8NDC4	146 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CATSPER2	Q96P56	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	CSF3R	Q99062	836 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZBTB18	Q99592	522 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	C1orf50	Q9BV19	199 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHTF8-206	ENST00000519534	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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